Publikationen von X. Gan

Zeitschriftenartikel (25)

2024
Zeitschriftenartikel
Emonet, A.; Awad, M.; Tikhomirov, N.; Vasilarou, M.; Pérez Antón, M.; Gan, X.; Novikova, P. Y.; Hay, A.: Polyploid genome assembly of Cardamine chenopodiifolia. bioRxiv: the preprint server for biology (2024)
Zeitschriftenartikel
Xuan, Y. H.; Wang, Y.; Gao, L.; Gan, X.: Editorial: Novel insights into the regulatory role of sugar and amino acids signaling in plant-microbe interactions. Frontiers in Plant Science 14, 1261186 (2024)
2023
Zeitschriftenartikel
Awad, M.; Gan, X.: GALA: a computational framework for de novo chromosome-by chromosome assembly with long reads. Nature Communications 14, 204 (2023)
Zeitschriftenartikel
Baumgarten, L.; Pieper, B.; Song, B.; Mane, S.; Lempe, J.; Lamb, J.; Cooke, E. L.; Srivastava, R.; Struett, S.; Zanko, D. et al.; Casimiro, P. G. P.; Hallab, A.; Cartolano, M.; Tattersall, A. D.; Huettel, B.; Filatov, D. A.; Pavlidis, P.; Neuffer, B.; Bazakos, C.; Schaefer, H.; Mott, R.; Gan, X.; Alonso-Blanco, C.; Laurent, S.; Tsiantis, M.: Pan-European study of genotypes and phenotypes in the Arabidopsis relative Cardamine hirsuta reveals how adaptation, demography, and development shape diversity patterns. PLoS Biology 21 (7), e3002191 (2023)
2021
Zeitschriftenartikel
Galstyan, A.; Sarchet, P.; Campos Martin, R.; Adibi, M.; Lachezar, N.; Pérez Antón, M.; Rambaud-Lavigne, L.; Gan, X.; Hay, A.: INDEHISCENT regulates explosive seed dispersal. bioRxive, 448014 (2021)
Zeitschriftenartikel
Winkelmueller, T. M.; Entila, F.; Anver, S.; Piasecka, A.; Song, B.; Dahms, E.; Sakakibara, H.; Gan, X.; Kułak, K.; Sawikowska, A. et al.; Krajewski, P.; Garrido-Oter, R.; Tsiantis, M.; Fukushima, K.; Schulze-Lefert, P.; Laurent, S.; Bednarek, P.; Tsuda, K.: Gene expression evolution in pattern-triggered immunity within Arabidopsis thaliana and across Brassicaceae species. The Plant Cell, koab073 (2021)
2020
Zeitschriftenartikel
Akiyama, R.; Sun, J.; Hatakeyama, M.; Lischer, H. E. L.; Briskine, R. V.; Hay, A.; Gan, X.; Tsiantis, M.; Kudoh, H.; Kanaoka, M. et al.; Sese, J.; Shimizu, K. K.; Shimizu-Inatsugi, R.: Fine-scale empirical data on niche divergence and homeolog expression patterns in an allopolyploid and its diploid progenitor species. New Phytologist 229, S. 3587 - 3601 (2020)
Zeitschriftenartikel
Zhang, Z.; Runions, A.; Mentink, R. A.; Kierzkowski, D.; Karady, M.; Hashemi, B.; Huijser, P.; Strauß, S.; Gan, X.; Ljung, K. et al.; Tsiantis, M.: A WOX/Auxin Biosynthesis Module Controls Growth to Shape Leaf Form. Current Biology 30, S. 4857 - 4868.e6 (2020)
Zeitschriftenartikel
Zhou, Y.; Gan, X.; Vinegra de la Torre, N.; Neumann, U.; Albani, M.: Beyond flowering time: diverse roles of an APETALA2-like transcription factor in shoot architecture and perennial traits. New Phytologist (2020)
2019
Zeitschriftenartikel
Chen, Q.; Jiang, T.; Liu, Y.-X.; Liu, H.; Zhao, T.; Liu, Z.; Gan, X.; Hallab, A.; Wang, X.; He, J. et al.; Ma, Y.; Zhang, F.; Jin, T.; Schranz, M. E.; Wang, Y.; Bai, Y.; Wang, G.: Recently duplicated sesterterpene (C25) gene clusters in Arabidopsis thaliana modulate root microbiota. SCIENCE CHINA-LIFE SCIENCES 62 (7), S. 947 - 958 (2019)
Zeitschriftenartikel
Hajheidari, M.; Wang, Y.; Bhatia, N.; Vuolo, F.; Franco-Zorrilla, J. M.; Karady, M.; Mentink, R. A.; Wu, A.; Rilwan Oluwatobi, B. R.; Müller, B. et al.; Dello Ioio, R.; Laurent, S.; Ljung, K.; Huijser, P.; Gan, X.; Tsiantis, M.: Autoregulation of RCO by low-affinity binding modulates cytokinin action and shapes leaf diversity. Current Biology (2019)
Zeitschriftenartikel
Molina-Contreras, M. J.; Paulisic, S.; Then, C.; Moreno-Romero, J.; Pastor-Andreu, P.; Morelli, L.; Roig-Villanova, I.; Jenkins, H.; Hallab, A.; Gan, X. et al.; Gomez-Cadenas, A.; Tsiantis, M.; Rodriguez-Concepcion, M.; Martinez-Garcia, J. F.: Photoreceptor Activity Contributes to Contrasting Responses to Shade in Cardamine and Arabidopsis Seedlings. The Plant Cell 31 (11), S. 2649 - 2663 (2019)
Zeitschriftenartikel
Nikolov, L. A.; Shushkov, P.; Nevado, B.; Gan, X.; Al-Shehbaz, I. A.; Filatov, D.; Bailey, C. D.; Tsiantis, M.: Resolving the backbone of the Brassicaceae phylogeny for investigating trait diversity. New Phytologist 222, S. 1638 - 1651 (2019)
Zeitschriftenartikel
Song, B.; Sang, Q.; Wang, H.; Pei, H.; Gan, X.; Wang, F.: Complement Genome Annotation Lift Over Using a Weighted Sequence Alignment Strategy. Frontiers in Genetics 10, 1046 (2019)
2018
Zeitschriftenartikel
Song, B.; Mott, R.; Gan, X.: Recovery of novel association loci in Arabidopsis thaliana and Drosophila melanogaster through leveraging INDELs association and integrated burden test. PLoS Genetics 14 (10), e1007699 (2018)
Zeitschriftenartikel
Vuolo, F.; Kierzkowski, D.; Runions, A.; Hajheidari, M.; Mentink, R. A.; Das Gupta, M.; Zhang, Z.; Vlad, D.; Wang, Y.; Pecinka, A. et al.; Gan, X.; Hay, A.; Huijser, P.; Tsiantis, M.: LMI1 homeodomain protein regulates organ proportions by spatial modulation of endoreduplication. Genes and Development 32, S. 1361 - 1366 (2018)
2017
Zeitschriftenartikel
Imprialou, M.; Kahles, A.; Steffen, J. G.; Osborne, E. J.; Gan, X.; Lempe, J.; Bhomra, A.; Belfield, E.; Visscher, A.; Greenhalgh, R. et al.; Harberd, N. P.; Goram, R.; Hein, J.; Robert-Seilaniantz, A.; Jones, J.; Stegle, O.; Kover, P.; Tsiantis, M.; Nordborg, M.; Rätsch , G.; Clark, R. M.; Mott, R.: Genomic Rearrangements in Arabidopsis Considered as Quantitative Traits. Genetics 205 (4), S. 1425 - 1441 (2017)
2016
Zeitschriftenartikel
Alonso-Blanco, C.; Andrade, J.; Becker, C.; Bemm, F.; Bergelson, J.; Borgwardt, K. M.; Cao, J.; Chae, E.; Dezwaan, T. M.; Ding, W. et al.; Ecker, J. R.; Exposito-Alonso, M.; Farlow, A.; Fitz, J.; Gan, X.; Grimm, D. G.; Hancock, A. M.; Henz, S. R.; Holm, S.; Horton, M.; Jarsulic, M.; Kerstetter, R. A.; Korte, A.; Korte, P.; Lanz, C.; Lee, C.-R.; Meng, D.; Michael, T. P.; Mott, R.; Muliyati, N.W.; Nägele, T.; Nagler, M.; Nizhynska, V.; Nordborg, M.; Novikova, P. Y.; Picó, F. X.; Platzer, A.; Rabanal, F. A.; Rodriguez, A.; Rowan, B. A.; Salomé, P. A.; Schmid, K. J.; Schmitz, R. J.; Seren, Ü.; Sperone, F. G.; Sudkamp, M.; Svardal, H.; Tanzer, M. M.; Todd, D.; Volchenboum, S. L.; Wang, C.; Wang, G.; Wang, X.; Weckwerth, W.; Weigel, D.; Zhou, X.: 1,135 Genomes Reveal the Global Pattern of Polymorphism in Arabidopsis thaliana. Cell 166, S. 481 - 491 (2016)
Zeitschriftenartikel
Gan, X.; Hay, A.; Kwantes, M.; Haberer, G.; Hallab, A.; Dello Ioio, R.; Hofhuis, H.; Pieper, B.; Cartolano, M.; Neumann, U. et al.; Nikolov, L. A.; Song, B.; Hajheidari, M.; Briskine, R.; Kougioumoutzi, E.; Vlad, D.; Broholm, S.; Hein, J.; Meksem, K.; Lightfoot, D.; Shimizu, K. K.; Shimizu-Inatsugi, R.; Imprialou, M.; Kudrna, D.; Wing, R.; Sato, S.; Huijser, P.; Filatov, D.; Mayer, K. F. X.; Mott, R.; Tsiantis, M.: The Cardamine hirsuta genome offers insight into the evolution of morphological diversity. Nature Plants 2 (10), 16167 (2016)
Zeitschriftenartikel
Hofhuis, H.; Moulton, D.; Lessinnes, T.; Routier-Kierzkowska, A.-L.; Bomphrey, R.J.; Mosca, G.; Reinhardt, H.; Sarchet, P.; Gan, X.; Tsiantis, M. et al.; Ventikos, Y.; Walker, S.; Goriely, A.; Smith, R. S.; Hay, A.: Morphomechanical Innovation Drives Explosive Seed Dispersal. Cell 166 (1), S. 222 - 33 (2016)
2015
Zeitschriftenartikel
Cai, N.; Bigdeli, T. B.; Kretzschmar, W.; Li, Y.; Liang, J.; Song, L.; Hu, J.; Li, Q.; Jin, W.; Hu, Z. et al.; Wang, G.; Wang, L.; Qian, P.; Liu, Y.; Jiang, T.; Lu, Y.; Zhang, X.; Yin, Y.; Li, Y.; Xu, X.; Gao, J.; Reimers, M.; Webb, T.; Riley, B.; Bacanu, S.; Peterson, R. E.; Chen, Y.; Zhong, H.; Liu, Z.; Wang, G.; Sun, J.; Sang, H.; Jiang, G.; Zhou, X.; Li, Y.; Li, Y.; Zhang, W.; Wang, X.; Fang, X.; Pan, R.; Miao, G.; Zhang, Q.; Hu, J.; Yu, F.; Du, B.; Sang, W.; Li, K.; Chen, G.; Cai, M.; Yang, L.; Yang, D.; Ha, B.; Hong, X.; Deng, H.; Li, G.; Li, K.; Song, Y.; Gao, S.; Zhang, J.; Gan, Z.; Meng, H.; Pan, J.; Gao, C.; Zhang, K.; Sun, N.; Li, Y.; Niu, Q.; Zhang, Y.; Liu, T.; Hu, C.; Zhang, Z.; Lv, L.; Dong, J.; Wang, X.; Tao, M.; Wang, X.; Xia, J.; Rong, H.; He, Q.; Liu, T.; Huang, G.; Mei, Q.; Shen, Z.; Liu, Y.; Shen, J.; Tian, T.; Liu, X.; Wu, W.; Gu, D.; Fu, G.; Shi, J.; Chen, Y.; Gan, X.; Liu, L.; Wang, L.; Yang, F.; Cong, E.; Marchini, J.; Yang, H.; Wang, J.; Shi, S.; Mott, R.; Xu, Q.; Wang, J.; Kendler, K. S.; Flint, J.: Sparse whole-genome sequencing identifies two loci for major depressive disorder. Nature 523 (7562), S. 588 - 591 (2015)
Zeitschriftenartikel
Cai, N.; Chang, S.; Li, Y.; Li, Q.; Hu, J.; Liang, J.; Song, L.; Kretzschmar, W.; Gan, X.; Nicod, J. et al.; Rivera, M.; Deng, H.; Du, B.; Li, K.; Sang, W.; Gao, J.; Gao, S.; Ha, B.; Ho, H.-Y.; Hu, C.; Hu, J.; Hu, Z.; Huang, G.; Jiang, G.; Jiang, T.; Jin, W.; Li, G.; Li, K.; Li, Y.; Li, Y.; Li, Y.; Lin, Y.-T.; Liu, L.; Liu, T.; Liu, Y.; Liu, Y.; Lu, Y.; Lv, L.; Meng, H.; Qian, P.; Sang, H.; Shen, J.; Shi, J.; Sun, J.; Tao, M.; Wang, G.; Wang, G.; Wang, J.; Wang, L.; Wang, X.; Wang, X.; Yang, H.; Yang, L.; Yin, Y.; Zhang, J.; Zhang, K.; Sun, N.; Zhang, W.; Zhang, X.; Zhang, Z.; Zhong, H.; Breen, G.; Wang, J.; Marchini, J.; Chen, Y.; Xu, Q.; Xu, X.; Mott, R.; Huang, G.-J.; Kendler, K.; Flintl, J.: Molecular Signatures of Major Depression. CURRENT BIOLOGY 25 (9), S. 1146 - 1156 (2015)
2014
Zeitschriftenartikel
Hay, A.; Pieper, B.; Cooke, E.; Mandakova, T.; Cartolano, M.; Tattersall, A. D.; Ioio, R. D.; McGowan, S. J.; Barkoulas, M.; Galinha, C. et al.; Rast, M. I.; Hofhuis, H.; Then, C.; Plieske, J.; Ganal, M.; Mott, R.; Martinez-Garcia, J. F.; Carine, M. A.; Scotland, R. W.; Gan, X.; Filatov, D. A.; Lysak, M. A.; Tsiantis, M.: Cardamine hirsuta: a versatile genetic system for comparative studies. The Plant Journal 78 (1), S. 1 - 15 (2014)
Zeitschriftenartikel
Nelson, A. D. L.; Forsythe, E. S.; Gan, X.; Tsiantis, M.; Beilstein, M. A.: Extending the model of Arabidopsis telomere length and composition across Brassicaceae. SI 22 (2), S. 153 - 166 (2014)
Zeitschriftenartikel
Vlad, D.; Kierzkowski, D.; Rast, M. I.; Vuolo, F.; Dello Ioio, R.; Galinha, C.; Gan, X.; Hajheidari, M.; Hay, A.; Smith, R. S. et al.; Huijser, P.; Bailey, C. D.; Tsiantis, M.: Leaf Shape Evolution Through Duplication, Regulatory Diversification, and Loss of a Homeobox Gene. Science 343 (6172), S. 780 - 783 (2014)
Zur Redakteursansicht